Informe de buenas vibraciones sobre la unión a cuádruplex de ADN de una sonda IR de polipiridilo de rutenio amplificada en estado excitado

Título	Informe de buenas vibraciones sobre la unión a cuádruplex de ADN de una sonda IR de polipiridilo de rutenio amplificada en estado excitado
Autores	Mark Stitch, Davide Avagliano, Daniel Graczyk, Ian P. Clark, Leticia González, Michael Towrie, Susan J Quinn
Revista	Revista de la Sociedad Química Americana
Fecha	09/22/2023
DOI	https://doi.org/10.1021/jacs.3c06099
Introducción	El estudio demuestra cómo el complejo de Ru(II)polipiridilo con nitrilo actúa como sonda infrarroja sensible para estructuras G-cuadruplex. La espectroscopia de absorción UV-visible muestra la unión específica de enantiómeros para los G4s híbridos htel(K) y antiparalelos htel(Na) formados por la secuencia del telómero humano. La espectroscopia infrarroja de tiempo resuelto (TRIR) del complejo con excitación a 400 nm revela interacciones dominantes con bases de guanina para las uniones Λ-1/htel(K), Δ-1/htel(K) y Λ-1/htel(Na). Por el contrario, la unión Δ-1/htel(Na) interactúa con bases de timina y adenina en el bucle. El transitorio de nitrilo a 2232 cm-1 se desplaza linealmente a una frecuencia más baja a medida que disminuye el entorno de enlace de hidrógeno en mezclas DMSO/agua, sirviendo como indicador del entorno de nitrilo dentro del bolsillo de unión. El tiempo de vida del complejo en D2O aumenta al unirse el ADN, lo que indica una mayor protección del entorno del disolvente, corroborado por simulaciones de dinámica molecular y cálculos de energía de unión. Esto subraya la utilidad de las sondas IR para determinar los sitios de unión de los agentes fotoactivos y su potencial para informar sobre entornos biológicos.
Cita	Mark Stitch, Davide Avagliano y Daniel Graczyk et al. Good Vibrations Report on the DNA Quadruplex Binding of an Excited State Amplified Ruthenium Polypyridyl IR Probe. J. Am. Chem. Soc. 2023. Vol. 145(39):21344-21360. DOI: 10.1021/jacs.3c06099
Elemento	Rutenio (Ru) , Sodio (Na) , Potasio (K)
Materiales	Compuestos químicos
Temas	Materiales fotónicos y optoelectrónicos , Materiales biomédicos

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